Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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