Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1b4Q99ME6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms