Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncaipQ99ME3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncaipQ99ME3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms