Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms