Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms