Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcc1Q99LI2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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