Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp16Q99LG0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms