Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms