Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms