Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf34Q99KR6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms