Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ciao1Q99KN2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms