Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dok4Q99KE3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms