Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlgn1Q99K10 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms