Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacsin3Q99JB8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms