Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan1Q99J59 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms