Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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