Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf3Q922U1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms