Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tubb6Q922F4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms