Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Afg3l1Q920A7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1Q920A7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms