Protein–RNA interactions for Protein: Q920A5

Scpep1, Retinoid-inducible serine carboxypeptidase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scpep1Q920A5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Scpep1Q920A5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scpep1Q920A5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms