Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms