Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atpaf2Q91YY4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms