Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx4Q91YJ2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms