Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl3Q91YH5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms