Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhb12Q91Y07 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms