Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16bQ91XT4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms