Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx11Q91WL6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx11Q91WL6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Snx11Q91WL6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Snx11Q91WL6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx11Q91WL6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms