Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep1Q91W92 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms