Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms