Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps3Q91VB4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps3Q91VB4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps3Q91VB4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms