Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1Q91V10 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsx1Q91V10 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsx1Q91V10 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms