Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cabp4Q8VHC5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms