Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenomQ8VHC3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms