Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt79Q8VED5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt79Q8VED5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt79Q8VED5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt79Q8VED5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt79Q8VED5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt79Q8VED5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt79Q8VED5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt79Q8VED5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt79Q8VED5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt79Q8VED5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt79Q8VED5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt79Q8VED5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt79Q8VED5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt79Q8VED5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms