Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8VDP2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms