Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VCE4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VCE4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms