Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Rapgef3Q8VCC8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Rapgef3Q8VCC8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rapgef3Q8VCC8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rapgef3Q8VCC8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rapgef3Q8VCC8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rapgef3Q8VCC8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rapgef3Q8VCC8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Rapgef3Q8VCC8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Rapgef3Q8VCC8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Rapgef3Q8VCC8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms