Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BbxQ8VBW5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms