Protein–RNA interactions for Protein: Q8R422

Cd109, CD109 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd109Q8R422 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd109Q8R422 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd109Q8R422 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms