Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms