Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaaf4Q8R368 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms