Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms