Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N0

Ccdc59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc59Q8R2N0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc59Q8R2N0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms