Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b4Q8QZY9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms