Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Treml1Q8K558 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms