Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms