Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf39Q8K2Z2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms