Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc12Q8K2L8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc12Q8K2L8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Trappc12Q8K2L8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Trappc12Q8K2L8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc12Q8K2L8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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