Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms