Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek9Q8K1R7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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